1ª Fase: Vinte equipes, divididas em dois grupos regionais de dez, jogam em turno e returno dentro dos grupos. As quatro primeiras colocadas de cada grupo classificam-se para as quartas-de-final. As duas piores de cada grupo são rebaixadas para a série D.

Quartas-de-final: Em jogos de ida e volta. Os vencedores sobem para a série B em 2017.

Semifinais e Final: Em jogos de ida e volta.

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